Donatello était l’une des quatre tortues transformées en mutantes après être rentré en contact avec du mutagène dans les égouts de New York. Le mutagène donnait à ceux qui le touchait, l’apparence de la dernière chose vivante touchée. Ayant été recueilli par Hamato Yoshi, un humain, il gagna cette apparence humanoïde à son tour. Yoshi se  transforma en rat, et adopta les quatre tortues, qui vécurent dans les égouts. Il leur enseigna l’ancien art du ninjutsu. Chaque tortue bénéficia d’une arme qui lui était propre. Donatello choisit le bâton bō.

Après avoir sauvé April avec ses frères, ils remontèrent la piste du Foot Clan, découvrant que le rival de leur maître, Oroku Saki, était à New York (TMNT A. Mini-series #1) et s’était allié à l’extraterrestre Krang pour dominer la Terre (TMNT A. Mini-series #2). Pour contrecarrer ses plans, il mit au point le Party wagon et le Turtle blimp (TMNT A. Mini-series #3).
Même si Krang et Shredder avaient été renvoyés en Dimension X, ses frères et lui durent encore affronter leurs ennemis par la suite. L’extraterrestre convoitait la Turnstone de Cherubae (TMNT A. #10). Cette dernière emmena les tortues sur la planète désolé d’Hirobyl pour livrer bataille à Krang (TMNT A. #12) et le bannir sur Morbus (TMNT A. #13).

De retour sur Terre, Donatello et ses frères furent envoyés en Amazonie pour sauver une journaliste, aidés de Jagwar, d’une bande de braconniers. Il s’agissait d’April (TMNT A. #14).

Créations de Donatello

• Party wagon
• Turtle blimp
• Cheapskate

Autour du personnage

• Le costume de Donatello au cours du tournoi sur l’astéroïde Stump est inspiré d’un essai de Kevin Eastman, qui voulait changer quelques détails aux Tortues Ninja à leurs débuts de l’ère Mirage Studios. On peut y voir quelques questions à propos de son accoutrement, de ses armes, et de la ceinture.

• Donatello bénéficia comme la plupart des autres personnages d’un comportement quasi-identique à celui de la série animée. Toutefois, les lignes directrices étant réalisées par Steve Murphy et Ryan Brown, de Mirage Studios, on retrouve également son côté pacifique, avec la haine des armes et la volonté de non combat.

• À partir du TMNT A. #15, Donatello possède un nouveau bâton, très ancien, offert par l’ancienne d’un village amazonien, Paleoncha, en guise de remerciement pour avoir libéré leur village. Son bâton s’était cassé lors du combat contre des mercenaires.

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